基地补给由横须贺海军补给站负责，舰艇和飞机用的燃油主要贮存在基地对岸港内的吾妻岛上，该岛上的贮油设施面积约84万平方米，是与日本共用的，有大小油库37区，贮油容量约40万千升，品种有航空汽油、喷气机油料、汽车汽油、柴油机重油等8种油料。