整个港区形似人的手掌，“大拇指”直接触摸横滨市，为第四区；由吾赛岛分割成的“食指”根上，有两道防波堤（东防波堤和东北防波堤），东北防波堤将“掌心，一分为二，在外的一半是外港，也是检疫锚地；靠里而的一半是内港的第三区。